Chương trình Khoa học máy tính trình độ thạc sĩ tại SIU cung cấp cho người học kiến thức chuyên sâu trên nền tảng rộng thuộc lĩnh vực Khoa học máy tính, đặc biệt là Trí tuệ nhân tạo (AI), Khoa học dữ liệu (DS), Máy học (ML), Dữ liệu lớn (Big Data), Thị giác máy tính, Xử lý ngôn ngữ tự nhiên (NPL), An ninh thông tin (Cybersecuirity), IoT… tạo điều kiện cho học viên phát triển kiến thức, năng lực chuyên môn, khả năng nghiên cứu và ứng dụng thực tế. Học viên theo học MCS tại SIU được học các chuyên đề phục vụ cho CMCN 4.0: AI và sự phát triển Kinh tế - Xã hội; Chuyển đổi số; IT và đô thị thông minh; Công nghệ Blockchain và ứng dụng… Học viên được hỗ trợ, tạo điều kiện tham gia một số hoạt động giao lưu và trải nghiệm quốc tế trong quá trình học, làm luận văn tốt nghiệp.